분자 동역학법의 뜻

원자 간 퍼텐셜로부터 구한 힘으로 많은 원자의 뉴턴 운동 방정식을 수치 적분해, 원자의 움직임을 시간에 따라 계산하는 방법.

일본어 명칭: 分子動力学法

‘분자 동역학법’ 관련 연습 문제는 1개 분야에 8문제가 있습니다(계산 재료과학 등).

이 용어의 분야: 계산 재료과학

분자 동역학법 연습 문제에 도전

분자 동역학법에서 시간 간격 2 fs로 운동 방정식을 적분하여 1 ns 동안의 원자 움직임을 계산하려고 한다. 필요한 시간 스텝 수는 얼마인가?

  1. A5×10²
  2. B5×10⁸
  3. C5×10⁵
정답과 해설 보기

정답: C. 5×10⁵

1 ns = 10⁻⁹ s, 2 fs = 2×10⁻¹⁵ s이므로 스텝 수는 10⁻⁹/(2×10⁻¹⁵) = 5×10⁵입니다. 시간 간격은 원자 진동의 주기(100 fs 정도)를 수십으로 나눌 정도로 작게 잡아야 하며, 가벼운 수소를 포함하는 계에서는 1 fs 이하로 합니다. 간격을 너무 크게 하면 베를레(Verlet)법 등 수치 적분의 오차로 에너지가 보존되지 않게 되어 계산이 성립하지 않게 됩니다. 5×10²는 fs를 10⁻¹² s(ps)로 혼동한 값, 5×10⁸은 ns를 10⁻⁶ s(µs)로 혼동한 값입니다. 스텝마다 모든 원자의 힘을 계산하므로, 나노초에서 마이크로초 정도가 분자 동역학법으로 추적할 수 있는 시간의 기준이 됩니다.

분자 동역학법에서 사용하는 원자 간 퍼텐셜에 대한 설명으로 옳은 것은 무엇인가?

  1. A레너드-존스 퍼텐셜은 두 원자 간의 거리만으로 결정되는 쌍 퍼텐셜로, 금속 결합이나 공유 결합의 방향성도 잘 나타낼 수 있다
  2. B내장 원자법(EAM) 퍼텐셜은 주위 원자가 만드는 전자 밀도에 따른 내장 에너지를 더하여 금속의 다체적인 결합을 나타낸다
  3. C실리콘과 같은 공유 결합 결정에는 결합 각도와 관계없는 쌍 퍼텐셜을 사용하는 것이 가장 적합하다
정답과 해설 보기

정답: B. 내장 원자법(EAM) 퍼텐셜은 주위 원자가 만드는 전자 밀도에 따른 내장 에너지를 더하여 금속의 다체적인 결합을 나타낸다

레너드-존스 퍼텐셜은 원자 2개의 거리만으로 결정되는 쌍 퍼텐셜로, 비활성 기체와 같은 방향성이 없는 약한 결합은 잘 나타내지만 금속이나 공유 결합의 성질은 나타낼 수 없습니다. 금속에서는 원자 1개의 결합 세기가 주위 원자의 수에 따라 변하는 다체 효과가 크며, EAM은 이것을 주위 원자가 만드는 전자 밀도의 함수로서 더합니다. 쌍 퍼텐셜만으로는 각 원자가 대칭 중심에 있는 FCC나 BCC 결정에서 응력이 없을 때 탄성 상수에 C₁₂ = C₄₄(코시 관계)가 반드시 성립하지만, 많은 금속은 이것을 만족하지 않습니다. 공유 결합에서는 결합 각도가 중요하므로, 각도 항을 포함하는 스틸린저-웨버나 터소프 퍼텐셜을 사용합니다. DFT 결과를 학습한 기계 학습 퍼텐셜도 널리 사용되고 있습니다.

해설 속의 ‘분자 동역학법’

‘분자 동역학법’ 관련 문제(8문제)

  1. 분자 동역학법에서 시간 간격 2 fs로 운동 방정식을 적분하여 1 ns 동안의 원자 움직임을 계산하려고 한다. 필요한 시간 스텝 수는 얼마인가?
  2. 분자 동역학법에서 사용하는 원자 간 퍼텐셜에 대한 설명으로 옳은 것은 무엇인가?
  3. 분자 동역학법 계산에서 단원자계의 원자 1개당 운동 에너지의 평균이 0.0517 eV였다. 에너지 등분배 법칙으로 구한 계의 온도에 가장 가까운 것은 무엇인가? 볼츠만 상수를 k = 8.617×10⁻⁵ eV/K로 한다.
  4. 재료의 계산 기법과 보통 다룰 수 있는 공간·시간 규모의 조합으로 가장 적절한 것은 무엇인가?
  5. 밀도 범함수 이론(DFT)의 사고방식에 대한 설명으로 옳은 것은 무엇인가?
  6. LDA나 GGA 교환 상관 범함수를 사용한 표준적인 DFT 계산 결과의 경향으로 옳은 것은 무엇인가?
  7. 키네틱 몬테카를로(kMC)법에 대한 설명으로 옳은 것은 무엇인가?
  8. 페이즈 필드법에 대한 설명으로 옳은 것은 무엇인가?

관련 용어

밀도 범함수 이론 원자 간 퍼텐셜 페이즈 필드법 유한 요소법 포논 공공 머티리얼즈 인포매틱스 몬테카를로법 CALPHAD법

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